失效，虽然恢复了殿前禁军和侍卫亲军的番号，可也是面目全非亟待重建。
选择何种方式比较合适，当下朝中也有争论，不过在这弹丸之地上根本没有前线和后方之分，哪种方式都是妄谈。不过那也不能说问题不存在，一旦发起复国之役，不会选择一个作战方向，尤其是在收复部分地盘后也要分兵驻守，从而就有可能形成新的军阀割据现象，但这也是当下最合理和有效的作战方式。
不过这么做同样会引起朝廷内部的争执，文天祥在行朝初立之时曾前往剑南开府独当一面，当他打出一片天地的时候，其实就已经埋下日后数次被拒回朝的祸根。其在剑南积蓄了力量，搞得声势浩大，树立了威望，朝中的人就开始猜忌文天祥另有图谋，担心其归朝后篡权把持朝政，最后终于把他推上了绝路。所以赵昺觉着以这种方式重建军制反对的声音会很大，且后期收拾起来也十分麻烦，说不得也会重现斩杀功臣的一幕。
基于现实和作战的需要，赵昺觉得干脆将团团伙伙全部打散，什么殿前禁军、侍卫亲军整个指挥系统全部撤销，将全军编成相当于现在的军或师为基础的独立单位。平时各自管理，各兵种进行训练，同时加强协同训练，并由枢密院组织各军联合演练。战时则根据任务的需要抽调各军、师编成集团军或是兵团，由朝廷选派将领指挥作战，与现代的模块化编组相似。如果成功，则以后组建战区也就顺理成章。
一个部队总要有它的行政管理系统，可是这个系统如果又要管行政，又要管作战，恐怕是忙不过来的。过去帅府即是行政管理的中枢，也是府军的最高指挥机构，从而形成了以军队为主体，其它机构辅助的结构，此后也不免将这种军队办社会的作风带进了各军之中。其实朝廷所属各军也好不到哪里去，都需要自己招兵买马，募集粮饷，承担起朝廷应该做的事情。
如此便形成了军队‘大而全’的局面，一个军事主官要承担着从吃、住、行到训练、管理和作战等各类工作。赵昺当初手下只有一帮残兵败将，老弱病残，力量一旦分散便无法生存，所以必须集中力量、统一调度，那也是无奈之举。但行朝迁琼后，最大的改变就是管理部门健全，职能部门得到充实，具体事务都有人管了。现在完全具备将军队的日常管理等职能剥离出去的条件。
如此今后就可以进行职能分工，突出指挥机构的作战功能；各军也能从从只注重本单位和本部门局部利益向着增强全局观念，全军和战场“一盘棋”转变；改变业已形成的军队各单位部门相对封闭式的军队建设管理，转向开放式的分工协作和各司其责；同时把过去的军队单打一、办社会，向着军民融合的社会化保障转变。军队就不必像办社会一样，什么都办，还有一些军队的设施机构、非战斗人员的部分可以精简，提高效率和战斗力……
赵昺接着便由将军队中的非职能部门剥离，转由兵部及其它相关部门管理说到了军政、军令分开。他自然清楚对上层的指挥系统进行改造，如果条件不具备时，或缺乏一定的法规制度基础、政治基础和军队管理水平达不到的情况下，盲目地走军政军令分开道路，会导致部队建设的混乱、管理的混乱和指挥的混乱，反而不利于军队的管理和作战。
但当下宋朝文人主政的制度恰与现代的国家体制暗合，如此赵昺就有机会实施贴近近现代军队的军事改革，可是采取何种形式他还是颇费了番心思。而说到这个问题他还想到一个美国人，这个人可以说对塑造美军的体系，提高其作战效率做出了很大的贡献，可少为人知的此人并非纯牌军人出身，确切的说是个商人。
此人就是原通用汽车公司老板麦克纳马拉，他担任美国国防部长之后，把美国企业的先进管理模式和成本核算方式带进了美军，使军队面貌为之大变，节约了大量经费，同时也大大提
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